En un juicio abreviado en 2015, tras aceptar su responsabilidad por contrataciones irregularidades en su gestión en el PAMI entre enero de 1997 y diciembre de 1999, Alderete fue condenado a tres años y medio de prisión e inhabilitación perpetua para ejercer cargos públicos.
Concretamente lo condenaron por comprar con sobreprecios cuarenta mil libros y el pago de 400 mil dólares a una empresa de servicios que no cumplió con su trabajo, con sobreprecios para la impresión del libro “PAMI, una transformación necesaria” .
Por esta causa, también recibieron condenas, con penas en suspenso, los ex funcionarios del PAMI Eduardo Polermann, Santiago Tomaghelli, Domingo Petrecca y María Maina.